La tecnología de genotipado detecta las variantes de covid-19 de forma más rápida y barata que nunca. La investigación estuvo a cargo de la Universidad de East Anglia (UEA) y la Agencia de Seguridad Sanitaria del Reino Unido.
El nuevo estudio, publicado este jueves 18 de enero, revela que la tecnología de genotipado detecta nuevas variantes de covid-19 casi una semana más rápidamente que los métodos tradicionales de secuenciación del genoma completo.
El equipo de investigación dice que el genotipo permitió que la información de la variante de covid se detectara más rápidamente y se comunicara a los profesionales de la protección de la salud de primera línea en el apogeo de la pandemia.
Es importante destacar que ayudó a implementar medidas de control local, como el rastreo de contactos, más rápidamente. El investigador principal, el profesor Iain Lake, comentó: “Cuando comenzó la pandemia de covid-19, la variante con la que se infectó a las personas se determinó inicialmente utilizando una técnica altamente precisa conocida como secuenciación del genoma completo”.
Añade: “Esta es la herramienta de oro para identificar y caracterizar genéticamente las variantes. Sin embargo, donde las grandes poblaciones necesitan ser evaluadas rápidamente, entonces el costo, la capacidad y la puntualidad limitan su utilidad.
“A principios de 2021 —agrega—, el gobierno estaba probando nueva tecnología para detectar rápidamente nuevas variantes en los laboratorios de pruebas y rastreo del NHS. La tecnología, conocida como ‘prueba de ensayo de genotipo’ o genotipo, permite a los científicos explorar variantes genéticas”.
Neil Bray, de la Agencia de Seguridad Sanitaria del Reino Unido (UKHSA), dijo: “Queríamos saber cómo se compara esta tecnología con la secuenciación tradicional del genoma completo”. El equipo de investigación estudió datos de más de 115,000 casos en los que la información de la variante de covid estaba disponible tanto en el genotipo como en la secuenciación de todo el genoma.
Al comparar el resultado de la variante del genotipado con el resultado de la secuenciación del genoma completo, demostraron que los resultados del genotipado eran muy precisos. El profesor Lake dijo: “Descubrimos que el genotipado era capaz de detectar variantes conocidas de covid-19 de manera más rápida y barata que la secuenciación de todo el genoma.
“Produjeron resultados de variantes seis días más rápidos que la secuenciación del genoma completo, con resultados en solo tres días. Ello en comparación con nueve días para la secuenciación del genoma completo. La genotipación permitió un aumento de nueve veces en la cantidad de muestras probadas para las variantes. Esto significó que se detectaron variantes entre muchas más personas. Por lo tanto, las medidas de control local, como el rastreo de contactos, podrían ocurrir más rápidamente”, dijo Lake.
Además, sumó: “El genotipado se puede aplicar para encontrar variantes en una amplia gama de organismos en humanos y animales. Ello tiene un enorme potencial para guiar la toma de decisiones y el control de enfermedades a nivel mundial en el futuro”.
La profesora Susan Hopkins, asesora médica jefe de la UKHSA, dijo: “La experiencia en genómica líder en el mundo que UKHSA y otras instituciones de todo el Reino Unido pudieron aprovechar durante la pandemia fue fundamental para la respuesta del Reino Unido al covid-19. Investigaciones como esta nos ayudarán a seguir construyendo nuestra capacidad en esta área y a garantizar que el Reino Unido esté lo mejor preparado posible para responder rápidamente a las amenazas emergentes a la salud pública en el futuro”.
La profesora Dame Anna Dominiczak, científica jefe de Salud en Escocia, dijo: “Una investigación como esta es realmente importante para garantizar que nos basamos en los enormes avances en las pruebas que ocurrieron durante el covid-19 para reforzar nuestras defensas contra futuras amenazas de pandemia”. N
